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T4 RNA Ligase 2, 1,000 U
T4 RNA Ligase 2は、RNAまたはDNAをドナー分子および・またはスプリント分子として用いて、切断された二本鎖（ds）核酸分子においてRNAをレセプター分子として利用するATP依存性RNAリガーゼです（ニックライゲーション）。この酵素は、鋳型依存的な方法で、5'-リン酸基を有する末端を持つ核酸ドナーと、3'-ヒドロキシル基を有する末端を持つ核酸アクセプターとの間に、ホスホジエステル結合が形成されるのを触媒します。T4 RNA Ligase 2は、ニッキングを受けた二本鎖RNA（dsRNA）に対して高い活性を示すが、一本鎖RNA（ssRNA）基質に対しては活性が低下します。
T4 RNA Ligase 2は、以下の用途に使用できます。
- 二本鎖核酸分子とRNA受容鎖との結合。
- スプリント分子を用いたssRNAの環状化。
- スプリント分子を用いたssRNAの末端タグ付け。
パフォーマンスデータ
Figure 1. T4 RNA Ligase 2による様々な二本鎖基質のニックライゲーション。T4 RNA Ligase 2は、RNA（青）またはDNA（赤）をドナー分子および・またはニックライゲーションのためのスプリント分子として利用し、ニックが形成された二本鎖核酸分子において、RNAをレセプター分子として用います。
mw) ssDNA molecular weight markers (bases, IDT)
1) non-RNase H treated
55-nt ssRNA oligonucleotide and
18-nt chimeric DNA6-RNA6-DNA6 oligonucleotide
2) RNase H treated
55-nt ssRNA oligonucleotide and
18-nt chimeric DNA6-RNA6-DNA6 oligonucleotide
3) T4 RNA Ligase 2 treated
34-nt and 21-nt RNase H-derived fragments and
18-nt chimeric DNA6-RNA6-DNA6 oligonucleotide
Figure 2. 55塩基のssRNAオリゴヌクレオチド（）を、18塩基のキメラDNA6-RNA4-DNA8単鎖オリゴヌクレオチド（）とハイブリダイズさせ、RNase Hで処理したところ、55塩基の単鎖RNAオリゴヌクレオチドが34塩基 () および 21塩基対 () の断片に切断されました。反応生成物を精製し、T4 RNA Ligase 2で処理しました。18塩基対のキメラDNA6-RNA4-DNA8一本鎖オリゴヌクレオチドは、ライゲーション反応時に55塩基対のssRNAオリゴヌクレオチドを修復するためのニックライゲーション用スプリントとして機能します。