Standard Cap, 2-Way™ Cap, ARCA Cap, Unmethylated Cap and Trimethyl Cap Analogs

"Cap"と呼ばれる修飾ヌクレオチド構造は、ほとんどの真核生物mRNAや多くのウィルスRNAの5'-未端に存在します。Cap Analogがin vitro transcription反応中に存在するGTPの一部分に置換される時、転写産物の80%までが5’-末端にCap構造を保持します。

Cap構造はin vitvoでのタンパク質合成の開始、mRNAのProcessingや安定化に重要な役割を果たしています¹。多くのウィルスRNAはCap化された時ときのみ感染し、トランスフェクションやマイクロインジェクションで細胞に導入されたCap化されていないRNAは、細胞中のRNaseにより迅速に分解されてしまいます^2,3。そのため卵母細胞へのマイクロインジェクションや真核細胞へのトランスフェクション用に調整されるRNAはCap化される必要があります。in vitroでCap化されたRNAは、ウサギ網状赤血球細胞ライセートや小麦胚芽翻訳システム4によるCap化されていない転写産物により効率的に翻訳されます。In vitro RNA スプライシング実験で使用される転写産物もまたCap化される必要があります。m^2,2,7G[5’]ppp[5’]G trimethylated capはRNA輸送^5,6や線虫のRNA翻訳⁷に重要な役割を果たしています。

3’-O-methyl-m7GpppGのようなAnti-Reverse Cap Analog(ARCA)は、O-methyl基のみ正方向に取り込まれる事が認められた事で、in vitroで効率良く翻訳された転写産物の合成中に発見されました。^8,9,10

さらに近年、Grudzien, E et al.¹¹は、in vitro transcription反応中に正方向にCapの100%が取り込まれる左右対称形状ジメチルCapが、ARCAよりもin vitro翻訳効率に効果をもたらすことを発表しました。

Figure 1. RNA Cap Analogs.

Applications

卵母細胞へのin vitro翻訳やマイクロインジェクション、真核生物へのトランスフェクション、RNAスプライシング実験のための5'-capped RNA合成

Storage Buffer & Concentration

Cap Analogsは、20 mMの溶液で提供されます。

References

1. Furuichi, Y et al. (1977) Nature 266, 235.
2. Krieg, PA and Melton, DA. (1984) Nucleic Acids Res. 12, 7057.
3. Drummond, DR et al. (1979) Nucleic Acids Res. 13, 7375.
4. Paterson, BM and Rosenberg, M. (1979) Nature 279, 692.
5. Fischer, U et al. (1991) J. Cell Biology 113, 705.
6. Hamm, J et al.(1990) Cell 62, 569.
7. Maroney, PA et al. (1995) RNA 1, 714.
8. Stepinski, J et al. (2001) RNA 7, 1486.
9. Peng, Z-H et al. (2002) Org. Lett. 4, 161.
10. Jemielity, J et al. (2003) RNA 9, 1108.
11. Grudzien, E et al. (2004) RNA 10, 1479.

Quantities of Cap Analogs are sometimes stated in absorbance units. One absorbance unit is equivalent to approximately 50 nmoles of Cap Analog.

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